贝加尔湖属于贫营养湖，水中的氮、磷等营养元素含量低，藻类等浮游动植物总量相对较少。湖随季节交替，湖盆中的水体一年内会发生两次大循环，属双循环湖。在这类湖泊中，湖水含氧量和水质随深度变化不大。[8]湖底结晶岩体很难溶解，进入水体的化合物主要来自大气降尘和地表径流。每年来自大气降尘的各种化学物质为1200千吨，来自沿岸大小河流的盐分为6013千吨、溶解物为7809千吨。粒子总浓度为120米g/L，其中，碳酸钙占84%、氯化物和硫化物占7%、碱性金属占9%，由于强烈的流水混合作用，化学组成均匀。因此，贝加尔湖湖水透明度深达40.5in，被誉为“西伯利亚的蓝眼睛”。
贝加尔湖对周围的气候有什么影响？
在世界上所有的淡水湖中，贝加尔湖的蓄水量是当之无愧的第一名，这个巨大的湖泊位于东西伯利亚南部区域，蓄水量高达32.6万亿立方米，占据了地球表面所有流动性淡水资源总量的20%左右。
如果从高空俯瞰，你会发现贝加尔湖的整体形状就像月牙一样（当然了，如果你说它像香蕉也不是不可以），测量数据显示，贝加尔湖的平均宽度约为48公里，长度约为638公里，面积大约为3.15万平方公里，平均水深730米，最深处可达1637米。
贝加尔湖的蓄水量之所以能够如此巨大，有很大的原因就是它实在是太深了，实际上，贝加尔湖除了是世界上蓄水量最大的淡水湖之外，还是世界上最深的湖泊。那么问题就来了，贝加尔湖为什么会那么深呢？
贝加尔湖的起源如上图所示，我们脚下的大地其实只是地球表面薄薄的一层，地球的岩石圈之下存在着一个软流圈，在高温高压的环境中，这里的物质大多数都处于熔融状态，具有缓慢“流动”的特性。
地球的岩石圈并不是一个整体，而是分为多个板块，这些板块就像“漂浮”在软流圈之上一样，随着软流圈的“流动”，这些板块也会发生运动，在这个过程中，板块和板块之间难免发生一些磕磕碰碰，如果碰撞得比较厉害，有些板块就可能会产生“裂缝”，而贝加尔湖就是这样一种“裂缝”。
科学界普遍认为，贝加尔湖形成于大约2500万年欧亚板块与印度板块碰撞之后的强烈地震，它本质上其实就是亚欧板块内部开裂而形成的一条“深谷”，相关研究表明，这条“深谷”在形成之初比现在的贝加尔湖还要深得多。
贝加尔湖的形成正所谓“人往高处走，水往低处流”，在上述的“深谷”形成之后，大量的水资源（如河流、冰川等）就开始向这里不断地汇聚，在漫长的地质演化过程中，周边区域的河流和冰川除了给这条“深谷”带来了巨量的水之外，还将大量的泥沙灌入其中。
随着时间的流逝，这些泥沙不断地沉积，这条“深谷”也变得越来越浅，并最终形成了现在我们看到的贝加尔湖。也就是说，尽管现在的贝加尔湖看起来很深，但实际上它却是在演化过程中变浅了很多，在它的湖水之下，其实还存在着比现在的湖水还要多的泥沙沉积物。
所以我们可以简单地理解为，在大约2500万年前，地球的板块运动使欧亚板块出现了一处深深的“裂缝”，由于地势较低，附近的水都会向这里汇集，久而久之，就形成了贝加尔湖。
需要指出的是，贝加尔湖之所以会那么深，其实还有两个重要的原因。首先就是贝加尔湖附近区域的水资源非常充沛，即使是现在，也依然有336条河流在不断地向贝加尔湖注入淡水，此外，研究人员还发现贝加尔湖的周边区域还存在大量的温泉，这说明了这片区域的地下水资源也很多。
还有一个原因就是，贝加尔湖位于北纬51度29分至55度46分之间，属于温带大陆性气候，这里的全年气温都相对比较低，在冬季的时候湖水还会结冰，这样的气候使得贝加尔湖的湖水的蒸发量很少，水也就不容易流失了。
作为对比，我们不妨来看看世界上第二深的湖泊——坦噶尼喀湖（Lake Tanganyika），坦噶尼喀湖也是一个淡水湖，位于东非大裂谷区的西部裂谷部分，其形成过程与贝加尔湖非常相似，面积也与贝加尔湖差不多（3.29万平方公里）。
但坦噶尼喀湖的水深却不如贝加尔湖（平均水深为570米，最深处可达1470米），为什么呢？最主要的原因就是坦噶尼喀湖位于南纬3度20分至8度48分之间，属于热带草原气候，这里全年气温偏高，湖水的蒸发量也就要比贝加尔湖大得多。
值得一提的是，科学家发现贝加尔湖所在的“裂缝”至今仍然在扩张，而坦噶尼喀湖所在的东非大裂谷也同样如此，这就意味着，如果这样的情形一直持续下去，那么在遥远的未来，世界上第一深和第二深的湖泊最终都会从地球上消失，它们会被海洋取而代之。
贝加尔湖周围地形
贝加尔湖周围地区的冬季气温，平均为－38℃，确实很冷，不过每年1月～5月，湖面封冻，放出潜热，已减轻了冬季的酷寒；夏季湖水解冻，大量吸热，降低了炎热程度，因而有人说，贝加尔湖是一个天然双向的巨型“空调机”，对湖滨地区的气候起着调节作用。
一年之中，尽管贝加尔湖面有5个月结起60厘米厚的冰，但阳光却能够透过冰层，将热能输入湖中形成“温室效应”，使冬季湖水接近夏天水温，有利于浮游生物繁殖，从而直接或间接为其它各类水生动物提供了食物，促进了它们的发育生长。据水下自动测温计测定，冬季贝加尔湖的底部水温至少有－4.4℃，比湖的表面水温高。贝加尔湖可调节湖滨的大陆性气候。
从地质构造上看，贝加尔湖是一个断谷的凹部，一个深入到地下15至20公里深处的大裂口。贝加尔湖和它的汇水区是世界上一个独特的地质体系。贝加尔湖位于西伯利亚东部中心地区，接近亚洲的地理中心。贝加尔湖的山谷洼地是西伯利亚地区重要的自然屏障。这一自然屏障将不同的动植物区分开，在这里生长着许多独特的生物群落。
贝加尔湖位於一很深的构造山谷地带，四周高山围绕，有的高出湖面2,000公尺(6,560呎)。湖底沉积层厚达6,100公尺(20,000呎)。岸边有死火山遗址。
湖底谷地两岸地形不对称，西岸为陡坡，东岸坡势较缓。8％的湖底很浅，只有50公尺(160呎)深。曲折的湖岸线总长2,100公里(1,300哩)，在巴尔古津湾、奇维尔库斯基(Chivyrkuysky)湾和普罗瓦尔湾，以及阿亚亚(Ayaya)小港和弗罗里哈(Frolikha)小港等处有很大的凹入处。东岸有一半岛伸入湖中，名圣角(Svyatoy Nos)半岛。湖中有27个岛屿，最大的岛屿是奥利洪达岛（长71.7千米，最宽15千米，面积约为730平方千米）。大乌什卡尼(Bolshoy Ushkany)岛面积8平方公里(3平方哩)。
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